Goodeidae
- Subfamilia Empetrichthyinae:
- Crenichthys (Hubbs, 1932)
- Empetrichthys (Gilbert, 1893)
- Subfamilia Goodeinae:
- Allodontichthys (Hubbs y Turner, 1939)
- Alloophorus (Hubbs y Turner, 1939)
- Allotoca (Hubbs y Turner, 1939)
- Ameca (Miller y Fitzsimmons, 1971)
- Ataeniobius (Hubbs y Turner, 1939)
- Chapalichthys (Meek, 1902)
- Characodon (Günther, 1866)
- Girardinichthys (Bleeker, 1860 )
- Goodea (Jordan, 1880)
- Hubbsina (Bleeker 1860)
- Ilyodon (Eigenmann, 1907)
- Neoophorus (Hubbs y Turner, 1939)
- Skiffia (Meek, 1902)
- Xenoophorus (Hubbs y Turner, 1939)
- Xenotaenia (Turner, 1946 )
- Xenotoca (Hubbs y Turner, 1939)
- Zoogoneticus (Meek, 1902)
- Especie Incertae sedis:
- Ilyodon paraguayense (Eigenmann, 1907)